反渗透设备运行流程分三部分。一部分为反渗透设备的预处理部分，一部分为反渗透脱盐处理部分，一部分为清洗部分。反渗透设备的预处理包括原水箱、石英砂过滤器、活性炭过滤器、阳离子交换器（或加药阻垢装置）、保安过滤器等。
预处理部分用于去除水中的悬浮物、胶体、钙镁离子等，以防止Ca、Mg、SiO2、Sr、Ba等物质在反渗透膜元件浓水侧产生结垢，为后续的脱盐处理提供条件；反渗透处理部分包括高压泵、反渗透装置，反渗透系统能脱除水中97%以上的盐份，达到出水水质要求。
石英砂过滤器工作原理：
1、石英砂过滤器是利用石英砂滤料去除原水中的悬浮物，属于普通快滤设备。 含有悬浮物颗粒的水流过砂滤器的滤料层时，滤料缝隙对悬浮物起筛滤作用使悬浮物易于截留在滤料表面。
2、当在滤料表层截留了一定量的污物形成滤膜，随时间推移过滤器的前后压差将会很快升高，直至失效。
3、此时需要利用逆向水流反洗滤料，使过滤器内石英砂层悬浮松动，从而使粘附于石英砂表面的截留物剥离并被水流带走，恢复过滤功能。
活性炭过滤器工作原理
活性碳过滤器主要是利用粒状活性碳的吸附机理来吸附水中的有机物和余氯，还可以去除胶体渣、铁化物、悬浮物，降低色度、浊度，保证后系统的正常运行，延长反渗透膜的使用寿命。
保安过滤器工艺原理：
利用PP滤芯10μm的孔隙进行机械过滤。水中残存的微量悬浮颗粒、胶体、微生物等，被截留或吸附在滤芯表面和孔隙中。随着制水时间的增长，滤芯因截留物的污染，运行阻力逐渐上升，当运行至进出口水压差达0.1Mpa以上时，需要更换滤芯。
精密过滤器的主要优点是效率高、阻力小、便于更换。
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